La serie nos presenta un hospital ficticio en Maine, sus empleados, pacientes y los sucesos paranormales que allí ocurren. La historia se centra principalmente en el doctor Hook y Peter Rickman.
Bajo el hospital se encuentran las ruinas de un molino que durante la Guerra Civil ardió provocando la muerte de numerosos niños. El espíritu de Mary, una de esos niños, deambula por el hospital en compañía de un extraño oso hormiguero.
Antes del Hospital Kingdom se había construido otro hospital que también quedó destruido como el molino y en el que contaban numerosas historias de fantasmas. El nuevo hospital ha heredado esas historias que son acentuadas por leves terremotos puntuales que solo son sentidos en el hospital.
Es el primer juego de la saga en incluir personajes que no pertenecen al univeso de Mortal Kombat, en este caso de la empresa DC cómics tales como Batman, Superman, Wonder Woman, etc.