A heroína Ripley ressuscita 200 anos depois dos últimos acontecimentos em Alien 3, através de um processo de clonagem. Finalmente, conseguem libertar Ripley da rainha alien, mas o ADN de uma e de outra misturaram se e a Ripley ganha características de alien, o que origina a uma nova raça de aliens.
A tenente Ripley se mata, para não permitir que o governo leve um monstruoso xenomorfo para o nosso planeta, mas após 200 anos, em uma nave espacial, ela acorda e descobre que cientistas a ressuscitaram através da clonagem e
conseguiram com sucesso retirar a rainha dos alienígenas.